鼻内镜手术和神经内镜手术，顾名思义是相同的来讲，就是用神经内镜工具来做手术。但是因为鼻内镜手术，这就涉及到学科的问题，实际上在外科领域尤其耳鼻喉科好多鼻腔的手术，鼻窦炎的手术，是用鼻内镜手术来做。但是到了神经外科领域就是属于脑垂体，或者是脑内，所以应用于神经外科手术的内镜系统，叫神经内镜，所以这就叫神经内镜手术。当然了会有相同的地方交叉，就是在耳鼻喉科，去做鼻窦炎副鼻窦炎手术的时候，也可能会用到神经内镜，这是一种工具。只是做到颅内的，神经内镜手术也可能用于做副鼻窦手术，所以工具可能是叫法不同。但如果是神经外科的手术，就是用神经病内镜来做神经外科的手术，应该叫神经内镜手术更合理。用神经内镜的手术，又包括经鼻，比如做垂体瘤，斜坡脊索瘤，这些实际上是用内镜的方法，经过蝶窦，甚至有时候会经过上颌窦做到侧颅底去，用的也是鼻内镜的方法，但实际上到达的区域，更靠近脑组织更靠近颅底，更深部位风险更高，所以这些叫利用神经内镜手术去做颅底的手术。
还有就是脑室内的肿瘤，甚至是幕上或者是后颅窝，就是脑内的肿瘤，颅底的手术是用内镜，不经鼻腔也就是经颅锁孔或者是股创去做，这也叫神经内镜颅内肿瘤手术。所以简单来讲，应该是神经内镜手术包含了经鼻内镜手术这部分。
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