荧光定量PCR(qPCR)问题汇总
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发布时间:2024-09-24 17:31
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时间:2024-09-24 17:59
1. 背景校正程序用于测量定量PCR仪所用反应管和水的空白荧光强度。在10分钟内,仪器连续读取背景校正板的荧光强度,温度为60°C。软件计算平均值,用于从实验数据中扣除背景信号。推荐每三个月到半年校正一次,以防因污染、反应板、水纯度变化等因素影响信号强度。
2. 实验可使用96孔光学反应板与膜、0.2ml光学八联反应管与膜、0.2ml光学八联反应管与盖。选择时需考虑兼容性与成本。
3. 磁盘碎片整理合并文件碎片,优化系统性能。在Windows下,右键点击硬盘,选择属性,工具,开始整理,执行碎片整理。
4. 除非有美国应用生物系统公司的通知,否则不要更新操作系统,以防SDS软件与新版本Windows操作系统冲突。
5. 定期备份实验数据,包括定量PCR仪的纯荧光光谱校正文件、背景文件和安装验证实验数据。备份频率推荐每周一次。
6. 良好的实验室环境有助于延长仪器寿命,如配备UPS、稳压器,良好通风,控制温度在10-30°C,湿度20-80%,配备除湿机等。
7. 运行背景校正反应板或执行ROI校正,以检测污染。使用乙醇清洁污染的反应孔,吹打后吸去废液,重复清洗,确保残留液体蒸发。
8. 开机顺序:先开电脑,再开定量PCR仪主机,待绿灯亮后开启软件。关机顺序:关闭软件,关闭主机,最后关闭电脑。
9. 纯荧光校正是为了让仪器识别各种荧光染料。推荐每半年进行一次校正,以保持准确度。
10. 使用光学膜密封96孔板,正确方法是纵向压膜,然后横向,最后边缘按压。
11. 单管或8连管实验时,建议对称纵向放置样品,优先第6列或第7列,提高数据精确性。
12. 绝对定量测定基因数目,相对定量比较基因含量百分比,无需知道拷贝数。绝对定量需使用标准品,相对定量可使用标准曲线或CT值比较法。
13. 实验数据需进行参比信号、内对照和基准样品校正。内对照校正使不同样本数据可相互比较。
14. 目标是研究药物处理后基因表达变化,内对照是18S RNA基因。实验数据通过标准曲线或CT值比较法处理。
15. ROX荧光校正确保实验结果的精密与可靠。仪器收集信号必须归一化校正,消除物理因素波动。
16. 每个反应管的探针数目受限于仪器、软件、试剂、实验设计和成本控制。最佳组合为4-5种荧光。
17. 内标法与外标法数据精确度相同,内标法优点是反应条件一致,外标法避免了竞争与抑制问题。