安徽中医学院创建于1959年，2000年省政府批准省医药学校并入该校。2005年，学校在国家教育部本科教学工作水平评估中取得良好成绩，被评为安徽省第七届文明单位；2006年，在安徽省大学生思想政治教育工作评估中获得优秀成绩。
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